A quinta etapa teve um ritmo muito forte, com o pelotão a conseguir anular a fuga inicial a dois quilómetros do fim. A partir daqui, cerca de 20 ciclistas estavam bem posicionados para lutar pela vitória.
O primeiro a tentar a sua sorte foi Gaetan Bille (Verandas Willems), o homem que andou dois dias de amarelo, mas Rui Sousa (Boavista) tinha outros planos e ajudou os restantes ciclistas a anularem a tentativa do belga.
A partir daqui foi Delio Fernández (Quinta da Lixa) quem saltou para a frente, tal como na Serra do Larouco. O problema é que José Gonçalves (Caja Rural) desta vez não queria ficar na sombra do espanhol, tal como aconteceu na segunda etapa, acabando por conseguir ultrapassar Fernández na melhor altura, somando o seu primeiro triunfo da carreira na Volta a Portugal.
O suspeito do costume, o camisola amarela Gustavo Veloso (Quinta da Lixa), acabou na terceira posição, com o mesmo tempo dos dois primeiros, acabando por perder apenas dois segundos na geral para Delio Fernández.
Na classificação geral, o pódio manteve-se igual. Gustavo Veloso em primeiro, com 15 segundos de vantagem para o segundo, Delio Fernández, e Jóni Brandão, quarto nesta etapa, em terceiro. No top 10, há três ciclistas espanhóis: Veloso em primeiro, Fernández em segundo, e Alejandro Marque (Efapel) em quinto. Os restantes sete são todos portugueses.
